发育不良、氮肥过量、感染病害等原因，均容易导致水稻出现黑色籽粒。
为减少该情况的发生，需保证土壤具有一定的透气性，施返青肥时，可选速效性的氮肥，如硫铵，不建议选缓释尿素。在整个生育期，尽量少施氮肥，多施其它微量元素含量多的肥料。
而在打苞孕穗期与灌浆期，可喷施咪鲜胺、稻瘟灵等药剂。平日需加强田间管理，及时防治鞘腐病，因为染上该病后，病斑处的稻粒会变成黑褐色。
一、水稻出现黑色籽粒的原因
1、发育不良
水稻出现黑稻粒，主要原因是由于种植后根系发育不良，没有办法正常的输送水分和养分，造成这种现象，大多跟地块不透气、土质黏重、土壤中细菌过多有关。
2、氮肥过量
在水稻生长过长中，施加大量的氮肥，尤其是尿素，会导致秧苗长势较差，结穗期出现黑粒的现象，在水稻生育期，应该少施氮肥，多施加其它微量元素较多的肥料。
3、感染病害
鞘腐病多是真菌病害，病斑主要发生在水稻剑叶叶鞘上，开始呈褐色小斑，逐渐扩大为不定型、颜色深浅不同的褐色斑块，包子上有病斑处稻粒会变成黑褐色。
4、防治方式
水稻苗期施肥，返青肥宜选用速效性的氮肥，如硫铵、氯氨等，不宜选用缓释的尿素，在打苞孕穗期和灌浆期喷施咪鲜胺、稻瘟灵、多抗霉素等药剂。
二、水稻红粒的原因
1、遭受病害
水稻出现红粒现象，可能是植株在生长的过程中出现细菌性褐斑病。水稻患上这种病害后，其叶片上就会出现褐色的小斑，并会一天天的扩大，最终出现叶尖发红，叶边发黄的现象，导致植株出现红粒。
2、喷洒药剂
在水稻出现红粒现象后，可以为其喷洒药剂。首先需要从市场上购买专用加收米药剂、多菌灵药剂以及抗霉素，然后按照包装上的剂量，将其与清水混合后，喷洒在水稻植株上，就可以消灭植株上的细菌。
3、通风透气
水稻出现红粒现象，可能是通风性差的缘故，在后期养护的过程中，就需要定期为水稻通风透气，保持环境的空气流通，也可以为水稻进行修剪，将其生长不良、没有办法正常生长的枝叶和植株剪去，保持植株间的空气流通。
4、注意事项
在为水稻喷洒药剂时，需要注意植株的生长状态，在水稻扬花期需要防止使用药剂，以免影响植株的产量，如果要使用药剂，则不可使用三唑类杀菌剂，以免影响水稻果粒的发育生长，出现空粒的现象。
